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极度濒危的澳杏耀洲坚果成为植物的超级模特



 
极度濒危的澳杏耀洲坚果成为植物的超级模特



世界上最稀有的树种之一被改造成一个复杂的模型,杏耀昆士兰大学的研究人员说,这是植物研究的未来。
 
昆士兰农业和食品创新联盟(QAAFI)的创新教授罗伯特·亨利(Robert Henry)说:“澳洲坚果是澳洲坚果的一种极度濒危物种,1991年才被称为新物种。”
 
“它生长在昆士兰州的米里亚姆河谷附近,目前已知的树只有大约100棵。”
 
然而, 杏耀平台总代结缘,在Hort Innovation的树木基因组项目和昆士兰大学的基因组创新中心Macadamia jansenii的资助下,Macadamia jansenii现在已经成为世界上最复杂的植物研究模型。
 
亨利教授说,澳洲坚果可能是地球上遗传学研究得最好的物种。
 
他说:“澳洲坚果有可能成为组装未来所有植物基因组的模型。”
 
亨利教授说,整个jansenii物种都生长在一个小区域。“这意味着我们有潜力研究整个物种的多样性,”他说。
 
“即使对稀有或濒危植物来说,这也很不寻常——这意味着我们可以获得关于稀有植物如何在小种群数量和相关基因瓶颈的影响下生存下来的大量信息。”
 
Henry教授表示,澳洲坚果的特殊特性有助于改进植物基因组测序和组装的技术和方法。
 
他说:“我们研究了不同的测序技术,所有可以用于基因组测序的不同软件和算法,然后将它们分别应用于相同的样本,找出最有效的方法。”
 
“这是一个漫长、复杂和昂贵的过程,所以我们想使用最新的技术来提高效率。”
 
基因组创新中心的Valentine Murigneux女士分析了基因组序列,然后QAAFI的研究人员与美国的实验室合作组装了该物种的所有14条染色体。这项工作发表在gigscience上。
 
亨利教授说,这项研究在全球范围内都很有意义。
 
他说:“高质量的基因组序列被证明比粗糙的草图序列更有用,错误更少,对植物育种的效果更好。”
 
澳洲坚果首次引起西方植物科学家的注意是在1983年,由来自昆士兰州中部一个南可兰的甘蔗种植者和熟练的业余植物学家Ray Jansen提出的。
 
澳洲坚果保护基金会执行官丹尼斯·邦德表示,杏2杏耀自2018年以来,已有大约60棵成熟的澳洲坚果树被找到,尽管其中四分之一在2019年的丛林大火中被烧毁。
 
Bond女士说:“我们非常欢迎对澳洲坚果的基因组研究,因为它将有助于优先考虑未来的保护工作,尽管目前最关键的事情是在它们的原始栖息地保护剩余的野生树木。”
 
她说,剩下的3种澳洲坚果——ternifolia、M. tetraphylla和M. integrifola——已于2020年被列入国际自然保护联盟的濒危物种红色名录。
 
“这给澳大利亚敲响了警钟,让它更好地保护本土澳洲坚果物种。”
 
亨利教授说,所有四种澳洲坚果植物——四叶坚果、整叶坚果、特叶坚果和延森坚果现在都进行了同样的分析。
 
他说:“这项工作是在昆士兰用澳洲坚果属进行的。澳洲坚果属是澳大利亚为数不多的世界粮食作物之一。
 
澳洲坚果基因组研究是一个五年计划的一部分,该计划为澳大利亚五种主要园艺作物——鳄梨、澳洲坚果、芒果、柑橘和杏仁——开发详细的高质量基因组测序,这五种作物占澳大利亚园艺作物价值的80%。
 
亨利教授说:“我们生成的澳洲坚果数据已被用于一系列项目,包括可持续强化树木作物生产的研究,以及澳洲坚果生产中关键商业属性的育种。”
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