所有哺乳动物的毛发颜色都由黑色素生成细胞决定，美国阿拉巴马州哈森阿尔法生物技术研究所遗传学家Greg Barsh说，这种黑色素细胞位于控制皮肤颜色的毛囊之间。
为什么斑马皮毛有条纹呢？研究动物色彩模式的遗传学家Barsh表示，这两个系统由不同的基因、荷尔蒙和其他因素控制。“人们知道有时这些条纹在毛发中非常明显，但它们在皮肤中却并不明显。”Barsh通过被驯化的猫、狗、马和斑马以及印度豹举例说。
例如，斑马黑白条纹的毛发下面是黑色的皮肤。丹麦哥本哈根大学材料学家Mads Bertelsen说，长颈鹿的皮肤是一种类似于其毛发的统一的淡棕色，其色彩模式是不可见的。
而与小型猫科动物血缘更近的印度豹“皮肤上显然没有斑点或线条。”南非濒危野生动物基因会生物学家Vincent van der Merwe说。然而，他表示，老虎等大型猫科动物的皮肤纹路却折射了它们的毛发纹路，雪豹也同样如此。Barsh表示，这可能是因为镶嵌在皮肤中的色彩毛囊是可见的，就像男性“五点钟的影子”——清晨刮过脸傍晚又长出的胡茬。
北极熊皮毛下面的皮肤则是黑色的，加拿大马尼托巴省保护区区域野生动物管理员Daryll Hedman说，这可能有助于它们吸收阳光。当北极熊在冬季脱去它们浓密的下层绒毛，就能看到“极小块的黑色皮肤”。
一些灵长类动物也有着彩色皮肤，尤其是包括山魈、长尾黑颚猴、洛马米长尾猴等在内的旧大陆猴，其中一些有着蓝色的睾丸。这种蓝色尚未完全理解，它们可能与性别选择存在关联。
当狒狒出生时，“它们的鼻子、爪子和耳朵都是粉色的，但会随着年龄增加而变暗。”日本京都大学野生生物学家Fred Bercovitch说。而它们的皮毛则相反，Bercovich说，“出生时是黑色的，杏耀代理而随着年龄变大会变成带斑纹的灰色。”
