导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒，杏耀挂机免疫系统难以捉摸的一个原因是它被一种叫做聚糖的糖所覆盖。一旦SARS-CoV-2感染了人的身体，它就会被这个人独特的多糖覆盖，这使得免疫系统很难识别出需要对抗的病毒。这些多糖在激活病毒方面也起着重要作用。加州大学圣迭戈分校(University of California, San Diego) Rommie Amaro和匹兹堡大学(University of Pittsburgh)莉莲·钟(Lillian Chong)实验室的研究生特拉·斯兹丹-佩多恩(Terra szain - pedone)和同事们研究了糖链是如何激活SARS-CoV-2的。szain - pedone将在2月25日星期四的第65届生物物理学会年会上介绍这项研究。

 

为了让SARS-CoV-2变得活跃和具有传染性，病毒外部的刺突蛋白需要改变形状，这样它才能粘到我们的细胞上。科学家们知道，覆盖在这些刺突上的多糖帮助SARS-CoV-2逃避免疫系统，但尚不清楚它们在激活过程中扮演什么角色。研究这些分子非常棘手，因为它们非常小，而且有许多以微妙方式运动的部分。szain - pedone解释说:“仅仅在一个spike蛋白模拟中就有50万个原子。”

 

该研究团队利用先进的高性能计算算法并行运行许多模拟，研究了当SARS-CoV-2脉冲被激活时， ，每个原子的位置是如何变化的。szain - pedone说:“如果有50万个原子，大多数计算机都无法做到这一点。”

 

研究小组能够识别出激活刺突蛋白的多糖和分子。“令人惊讶的是，杏耀下载一种聚糖似乎负责启动整个开放，”szain - pedone说。后续步骤还涉及到其他聚糖。为了验证他们的发现，该团队目前正在与德克萨斯大学奥斯汀分校的教授杰森·麦克莱伦(Jason McLellan)以及正在实验室进行刺突蛋白实验的同事合作。

 

有可能使用szain - pedone和同事开发的模拟来确定阻断或防止SARS-CoV-2激活的治疗方法。“因为我们有所有这些结构，我们可以用计算算法做小分子筛选，”szain - pedone解释说。他们也可以研究新的病毒突变，如目前正在传播的B.1.1.7变种，“看看它可能如何影响刺突蛋白的激活，”szain - pedone说。